Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms