Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL5

Tulp4, Tubby-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp4Q9JIL5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tulp4Q9JIL5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tulp4Q9JIL5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.5 ms