Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

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Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc22Q9JIG7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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