Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cldn19Q9ET38 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Cldn19Q9ET38 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cldn19Q9ET38 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cldn19Q9ET38 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Cldn19Q9ET38 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn19Q9ET38 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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