Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tm9sf3Q9ET30 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tm9sf3Q9ET30 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms