Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cpne8Q9DC53 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cpne8Q9DC53 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms