Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CrotQ9DC50 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CrotQ9DC50 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CrotQ9DC50 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CrotQ9DC50 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CrotQ9DC50 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CrotQ9DC50 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrotQ9DC50 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrotQ9DC50 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrotQ9DC50 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CrotQ9DC50 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrotQ9DC50 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrotQ9DC50 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrotQ9DC50 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrotQ9DC50 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrotQ9DC50 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CrotQ9DC50 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrotQ9DC50 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrotQ9DC50 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CrotQ9DC50 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms