Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc97Q9DBT3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ccdc97Q9DBT3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc97Q9DBT3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ccdc97Q9DBT3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc97Q9DBT3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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