Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Pop5Q9DB28 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms