Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smco2Q9DA21 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smco2Q9DA21 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smco2Q9DA21 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smco2Q9DA21 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smco2Q9DA21 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smco2Q9DA21 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smco2Q9DA21 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smco2Q9DA21 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smco2Q9DA21 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smco2Q9DA21 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smco2Q9DA21 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smco2Q9DA21 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smco2Q9DA21 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms