Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms