Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Nop56Q9D6Z1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Nop56Q9D6Z1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Nop56Q9D6Z1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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