Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Borcs6Q9D6W8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Borcs6Q9D6W8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Borcs6Q9D6W8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Borcs6Q9D6W8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Borcs6Q9D6W8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Borcs6Q9D6W8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Borcs6Q9D6W8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Borcs6Q9D6W8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms