Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D5Q8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D5Q8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms