Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PrameQ9D4Z5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PrameQ9D4Z5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PrameQ9D4Z5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PrameQ9D4Z5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PrameQ9D4Z5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PrameQ9D4Z5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PrameQ9D4Z5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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