Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms