Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lonrf3Q9D4H7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms