Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gcc1Q9D4H2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms