Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
4933428G20RikQ9D3X4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms