Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim42Q9D2H5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim42Q9D2H5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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