Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Mrpl28Q9D1B9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Mrpl28Q9D1B9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Mrpl28Q9D1B9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Mrpl28Q9D1B9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Mrpl28Q9D1B9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Mrpl28Q9D1B9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Mrpl28Q9D1B9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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