Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syf2Q9D198 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syf2Q9D198 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms