Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snf8Q9CZ28 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms