Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Utp23Q9CX11 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Utp23Q9CX11 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms