Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smurf1Q9CUN6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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