Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Chchd5Q9CQP3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms