Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rab5aQ9CQD1 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rab5aQ9CQD1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms