Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
1700029P11RikQ9CQ68 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms