Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
4921530L21RikQ9CQ47 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
4921530L21RikQ9CQ47 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
4921530L21RikQ9CQ47 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms