Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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