Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SrrtQ99MR6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrrtQ99MR6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms