Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc12a9Q99MR3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms