Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sh3bp5lQ99LH9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms