Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lysmd3Q99LE3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms