Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gps1Q99LD4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gps1Q99LD4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms