Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PpifQ99KR7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms