Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ubxn2aQ99KJ0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubxn2aQ99KJ0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms