Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tmed9Q99KF1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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