Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Higd1bQ99JY6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms