Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Def8Q99J78 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Def8Q99J78 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms