Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tspan1Q99J59 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms