Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms