Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim59Q922Y2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms