Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Traf7Q922B6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms