Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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Afg3l1Q920A7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Afg3l1Q920A7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Afg3l1Q920A7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Afg3l1Q920A7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Afg3l1Q920A7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Afg3l1Q920A7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Afg3l1Q920A7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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