Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpm2Q91YD4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms