Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Klc3Q91W40 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Klc3Q91W40 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms