Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Zkscan3Q91VW9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms