Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ccdc58Q8R3Q6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ccdc58Q8R3Q6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ccdc58Q8R3Q6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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