Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim29Q8R2Q0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms